计划主要内容包括定义和术语、监测项目类别（致病微生物、养殖环境和产品中藻类毒素、无机污染物（镉、铅、汞）、多环芳烃等有机污染物）、取样环节（覆盖养殖、采收、加工、流通等环节）、样品的采集、传递、接收、储存、检测和结果报告要求、官方监控频率、双壳贝类可食用部分中藻类毒素和有机污染物的限量规定（腹泻性贝类毒素最大限量为0.16mg/kg（以冈田酸含量计），麻痹性贝类毒素最大限量为0.8mg/kg（以石房蛤毒素含量计），苯并芘的最大限量为5μg/kg等）、不合格产品的调查处置和召回要求等。